ในซีซั่นที่ 6 ของ Grey’s Anatomy เรื่องราวของแพทย์ในโรงพยาบาล Seattle Grace ต้องเผชิญกับการเปลี่ยนแปลงครั้งใหญ่ เมื่อเกิดการรวมตัวกับโรงพยาบาล Mercy West ทำให้มีการเปลี่ยนแปลงทั้งในแง่ทีมแพทย์และวัฒนธรรมในองค์กร เหล่าศัลยแพทย์ฝึกหัดต้องต่อสู้เพื่อพิสูจน์ตัวเองและรักษาตำแหน่งไว้ในสภาพแวดล้อมที่ท้าทายมากยิ่งขึ้น
เหตุการณ์สำคัญในซีซั่นนี้เริ่มต้นด้วยการเสียชีวิตของ จอร์จ โอ’มัลลีย์ ซึ่งส่งผลกระทบอย่างลึกซึ้งต่อทุกคนในโรงพยาบาล ขณะเดียวกัน อิซซี่ สตีเวนส์ ต้องเผชิญกับปัญหาทั้งทางสุขภาพและความสัมพันธ์ จนท้ายที่สุดเธอตัดสินใจลาออกจากโรงพยาบาล
ซีซั่นนี้ยังแนะนำตัวละครใหม่อย่าง เท็ดดี้ อัลท์แมน ศัลยแพทย์หัวใจและทรวงอกที่เข้ามาร่วมทีม และยังเน้นถึงความเปลี่ยนแปลงในตำแหน่งหัวหน้าแผนกศัลยกรรมที่ส่งต่อให้กับ เดเร็ค เชพเพิร์ด การทำงานที่กดดันและความสัมพันธ์ระหว่างตัวละครยังคงสร้างความดราม่าเข้มข้นตลอดทั้งซีซั่น
ซีซั่นนี้ปิดท้ายด้วยเหตุการณ์ร้ายแรง เมื่อสามีของผู้ป่วยที่เสียชีวิตจากความผิดพลาดในโรงพยาบาลบุกเข้ามาก่อเหตุกราดยิงในโรงพยาบาล สร้างความตึงเครียดและความสูญเสียให้กับทีมแพทย์ทุกคน เหล่าศัลยแพทย์ต้องรวมพลังและต่อสู้เพื่อความอยู่รอด ในขณะเดียวกันก็ต้องเผชิญกับความเปราะบางทางจิตใจที่เกิดขึ้นหลังจากเหตุการณ์นี้